Přeskočit na obsah

Repozitář publikační činnosti

    • čeština
    • English
  • čeština 
    • čeština
    • English
  • Přihlásit se
Zobrazit záznam 
  •   Repozitář publikační činnosti UK
  • Fakulty
  • 2. lékařská fakulta
  • Zobrazit záznam
  • Repozitář publikační činnosti UK
  • Fakulty
  • 2. lékařská fakulta
  • Zobrazit záznam
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Gut-microbiota-based ensemble model predicts prognosis of pediatric inflammatory bowel disease

původní článek
Creative Commons License IconCreative Commons BY IconCreative Commons NC IconCreative Commons NC Icon
vydavatelská verze
  • žádná další verze
Thumbnail
File can be accessed.Získat publikaci
Autor
Ha, Sung Min
Lee, Kihyun
Kim, Gun Ha
Hurych, JakubORCiD Profile - 0000-0002-9813-5290Scopus Profile - 57221439347
Cinek, OndřejORCiD Profile - 0000-0002-0526-8714WoS Profile - AAF-6664-2020Scopus Profile - 6603698077
Shim, Jung Ok

Zobrazit další autory

Datum vydání
2024
Publikováno v
iScience
Ročník / Číslo vydání
27 (12)
ISBN / ISSN
ISSN: 2589-0042
ISBN / ISSN
eISSN: 2589-0042
Metadata
Zobrazit celý záznam
Kolekce
  • 2. lékařská fakulta

Tato publikace má vydavatelskou verzi s DOI 10.1016/j.isci.2024.111442

Abstrakt
Developing microbiome-based markers for pediatric inflammatory bowel disease (PIBD) is challenging. Here, we evaluated the diagnostic and prognostic potential of the gut microbiome in PIBD through a case-control study and cross-cohort analyses. In a Korean PIBD cohort (24 patients with PIBD, 43 controls), we observed that microbial diversity and composition shifted in patients with active PIBD versus controls and recovered at remission. We employed a differential abundance meta-analysis approach to identify microbial markers consistently associated with active inflammation and remission across seven PIBD cohorts from six countries (n = 1,670) including our dataset. Finally, we trained and tested various machine learning models for their ability to predict a patient's future remission based on baseline bacterial composition. An ensemble model trained with the amplicon sequence variants effectively predicted future remission of PIBD. This research highlights the gut microbiome's potential to guide precision therapy for PIBD.
Klíčová slova
Gastroenterology, Microbiome
Trvalý odkaz
https://hdl.handle.net/20.500.14178/3099
Zobraz publikaci v dalších systémech
WOS:001372456800001
SCOPUS:2-s2.0-85210763009
PUBMED:39691780
Licence

Licence pro užití plného textu výsledku: Creative Commons Uveďte původ-Neužívejte dílo komerčně-Nezpracovávejte 4.0 International

Zobrazit podmínky licence

xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-publication-version-

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
Atmire NV
 

 

O repozitáři

O tomto repozitářiAkceptované druhy výsledkůPovinné popisné údajePoučeníCC licence

Procházet

Vše v DSpaceKomunity a kolekcePracovištěDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slovaTato kolekcePracovištěDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slova

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
Atmire NV