Přeskočit na obsah

Repozitář publikační činnosti

    • čeština
    • English
  • čeština 
    • čeština
    • English
  • Přihlásit se
Zobrazit záznam 
  •   Repozitář publikační činnosti UK
  • Fakulty
  • Přírodovědecká fakulta
  • Zobrazit záznam
  • Repozitář publikační činnosti UK
  • Fakulty
  • Přírodovědecká fakulta
  • Zobrazit záznam
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Altitude shapes gut microbiome composition accounting for diet, thyroid hormone levels, and host genetics in a subterranean blind mole rat

původní článek
Creative Commons License IconCreative Commons BY Icon
vydavatelská verze
  • žádná další verze
Thumbnail
File can be accessed.Získat publikaci
Autor
Solak, Halil MertORCiD Profile - 0000-0001-6877-9274WoS Profile - T-3908-2017Scopus Profile - 57214988018
Kreisinger, JakubORCiD Profile - 0000-0001-9375-9814WoS Profile - H-4020-2011Scopus Profile - 13607593400
Čížková, Dagmar
Sezgin, Efe
Schmiedová, LucieORCiD Profile - 0000-0003-2180-5281WoS Profile - S-3351-2017Scopus Profile - 56538525200
Murtskhvaladze, Marine
Henning, Yoshiyuki
Çolak, Faruk
Matur, Ferhat
Yanchukov, Alexey

Zobrazit další autory

Datum vydání
2024
Publikováno v
Frontiers in Microbiology
Ročník / Číslo vydání
15 (November)
ISBN / ISSN
ISSN: 1664-302X
ISBN / ISSN
eISSN: 1664-302X
Metadata
Zobrazit celý záznam
Kolekce
  • Přírodovědecká fakulta

Tato publikace má vydavatelskou verzi s DOI 10.3389/fmicb.2024.1476845

Abstrakt
The animal gut microbiome acts as a crucial link between the host and its environment, playing a vital role in digestion, metabolism, physiology, and fitness. Using 16S rRNA metabarcoding, we investigated the effect of altitude on the microbiome composition of Anatolian Blind Mole Rats (Nannospalax xanthodon) across six locations and three altitudinal groups. We also factored in the host diet, as well as host microsatellite genotypes and thyroid hormone levels. The altitude had a major effect on microbiome composition, with notable differences in the relative abundance of several bacterial taxa across elevations. Contrary to prior research, we found no significant difference in strictly anaerobic bacteria abundance among altitudinal groups, though facultatively anaerobic bacteria were more prevalent at higher altitudes. Microbiome alpha diversity peaked at mid-altitude, comprising elements from both low and high elevations. The beta diversity showed significant association with the altitude. Altitude had a significant effect on the diet composition but not on its alpha diversity. No distinct altitude-related genetic structure was evident among the host populations, and no correlation was revealed between the host genetic relatedness and microbiome composition nor between the host microbiome and the diet. Free thyroxine (FT4) levels increased almost linearly with the altitude but none of the bacterial ASVs were found to be specifically associated with hormone levels. Total thyroxine (TT4) levels correlated positively with microbiome diversity. Although we detected correlation between certain components of the thyroid hormone levels and the microbiome beta diversity, the pattern of their relationship remains inconclusive.
Klíčová slova
gut microbiome, diet, thyroid, altitude adaptation, high altitude, blind mole rats, 16S, 18S
Trvalý odkaz
https://hdl.handle.net/20.500.14178/3095
Zobraz publikaci v dalších systémech
WOS:001356540600001
SCOPUS:2-s2.0-85209402918
PUBMED:39552645
Licence

Licence pro užití plného textu výsledku: Creative Commons Uveďte původ 4.0 International

Zobrazit podmínky licence

xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-publication-version-

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
Atmire NV
 

 

O repozitáři

O tomto repozitářiAkceptované druhy výsledkůPovinné popisné údajePoučeníCC licence

Procházet

Vše v DSpaceKomunity a kolekcePracovištěDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slovaTato kolekcePracovištěDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slova

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
Atmire NV