Přeskočit na obsah

Repozitář publikační činnosti

    • čeština
    • English
  • čeština 
    • čeština
    • English
  • Přihlásit se
Zobrazit záznam 
  •   Repozitář publikační činnosti UK
  • Fakulty
  • 3. lékařská fakulta
  • Zobrazit záznam
  • Repozitář publikační činnosti UK
  • Fakulty
  • 3. lékařská fakulta
  • Zobrazit záznam
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Integrative analysis of mRNA and miRNA expression profiles and somatic variants in oxysterol signaling in early-stage luminal breast cancer

původní článek
Creative Commons License IconCreative Commons BY Icon
postprint
  • žádná další verze
Thumbnail
File can be accessed.Získat publikaci
Autor
Holý, PetrORCiD Profile - 0000-0002-6950-5563WoS Profile - O-2307-2018Scopus Profile - 36917339500
Brynychová, VeronikaORCiD Profile - 0000-0001-7206-8942Scopus Profile - 55611626500
Šeborová, KarolínaORCiD Profile - 0000-0002-8925-2321WoS Profile - S-2866-2017Scopus Profile - 57206729991
Haničinec, Vojtěch
Koževnikovová, Renata
Trnková, Markéta
Vrána, David
Gatěk, Jiří
Kopečková, KateřinaScopus Profile - 57191164590
Mrhalová, MarcelaScopus Profile - 6602309568
Souček, PavelORCiD Profile - 0000-0002-4294-6799WoS Profile - H-8018-2019Scopus Profile - 55503473000

Zobrazit další autory

Datum vydání
2023
Publikováno v
Molecular Oncology
Ročník / Číslo vydání
17 (10)
ISBN / ISSN
ISSN: 1574-7891
Metadata
Zobrazit celý záznam
Kolekce
  • 2. lékařská fakulta
  • 3. lékařská fakulta

Tato publikace má vydavatelskou verzi s DOI 10.1002/1878-0261.13495

Abstrakt
Oxysterols, oxidized derivatives of cholesterol, act in breast cancer (BC) as selective estrogen receptor modulators and affect cholesterol homeostasis, drug transport, nuclear and cell receptors, and other signaling proteins. Using data from three highly overlapping sets of patients (N = 162 in total) with early-stage estrogen-receptor-positive luminal BC-high-coverage targeted DNA sequencing (113 genes), mRNA sequencing, and full micro-RNA (miRNA) transcriptome microarrays-we describe complex oxysterol-related interaction (correlation) networks, with validation in public datasets (n = 538) and 11 databases. The ESR1-CH25H-INSIG1-ABCA9 axis was the most prominent, interconnected through miR-125b-5p, miR-99a-5p, miR-100-5p, miR-143-3p, miR-199b-5p, miR-376a-3p, and miR-376c-3p. Mutations in SC5D, CYP46A1, and its functionally linked gene set were associated with multiple differentially expressed oxysterol-related genes. STARD5 was upregulated in patients with positive lymph node status. High expression of hsa-miR-19b-3p was weakly associated with poor survival. This is the first study of oxysterol-related genes in BC that combines DNA, mRNA, and miRNA multiomics with detailed clinical data. Future studies should provide links between intratumoral oxysterol signaling depicted here, circulating oxysterol levels, and therapy outcomes, enabling eventual clinical exploitation of present findings.
Klíčová slova
Oxysterols, breast cancer, interaction network, multiomics, integrative analysis, survival
Trvalý odkaz
https://hdl.handle.net/20.500.14178/2023
Zobraz publikaci v dalších systémech
WOS:001050479600001
SCOPUS:2-s2.0-85168317571
PUBMED:37491786
Licence

Licence pro užití plného textu výsledku: Creative Commons Uveďte původ 4.0 International

Zobrazit podmínky licence

xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-publication-version-

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
Atmire NV
 

 

O repozitáři

O tomto repozitářiAkceptované druhy výsledkůPovinné popisné údajePoučeníCC licence

Procházet

Vše v DSpaceKomunity a kolekcePracovištěDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slovaTato kolekcePracovištěDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slova

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
Atmire NV